商业承兑托收需要盖章的位置是 托收凭证的第二联。具体操作步骤如下：
1. 持票人填写托收凭证，并在汇票最后背书人签章处加盖持票人预留印鉴。
2. 托收行审核汇票背书是否连续、是否存在瑕疵，审核无误后在托收凭证第三联加盖结算专用章。
3. 托收行受理托收后，在托收凭证第一联加盖托收行业务公章及经办人名章，交客户作受理回单。
4. 通过特快专递方式将托收凭证第三、四、五联与汇票一同寄往付款行。
因此，在商业承兑托收过程中，应在托收凭证的第二联上盖上“财务专用章”和“法人章”，以表明收款人的身份和委托开户银行办理托收款项的意愿。