起草合作协议的原因主要有以下几点：
确保合作顺利进行：
签订合作协议可以确保双方的合作事项顺利进行，防止因违约导致合作中断。
明确权利义务：
通过合同的形式，可以明确双方或多方在合作中的权利和义务，减少因误解或沟通不畅导致的纠纷。
提供法律依据：
合同具有法律约束力，违反合同条款需要承担相应的法律责任，这为合作提供了法律保障。
防止违约行为：
合同可以规定违约的后果和救济措施，起到预防和威慑违约行为的作用。
补充和完善合同条款：
在合同具体条款不明确或不一致时，合同目的可以作为补充和完善条款的依据，确保合同的有效性和可执行性。
确定合同效力：
合作协议可以作为确定合同效力的依据，为合作双方提供明确的法律指引。
评估风险和利益：
在起草协议前，双方应充分评估合作中的风险和利益，确保协议内容的公平性和合理性，避免未来可能出现的争议。
记录合作内容：
合作协议是双方合作的具体记录，详细列明合作事项、期限、方式、责任等，有助于在合作过程中和结束后进行回顾和总结。
综上所述，起草合作协议是确保合作顺利进行、明确权利义务、提供法律保障、防止违约行为、补充合同条款、确定合同效力、评估风险和利益以及记录合作内容的重要手段。通过签订合作协议，合作双方可以更加规范地进行合作，降低风险，实现共同的目标和利益。