房屋确权手续应当在 不动产登记机构进行办理。根据《不动产登记暂行条例》第十五条的规定，当事人或者其代理人应当向不动产登记机构申请不动产登记。不动产登记机构将申请登记事项记载于不动产登记簿前，申请人可以撤回登记申请。第二十条规定，不动产登记机构应当自受理登记申请之日起30个工作日内办结不动产登记手续，法律另有规定的除外。第二十一条规定，登记事项自记载于不动产登记簿时完成登记。
具体办理流程如下：
1. 申请人到房屋所在区房管局填写房产登记申请审批书，提供规定的资料进行登记。
2. 区房管局对申报资料进行初审，并到现场勘测丈量、绘制平面图。
3. 符合登记要求的，将全部资料一式二份，图纸一式三份，报市房屋产权登记中心审批填制房屋权属证书。
4. 市房屋产权登记中心委托区房管局将权属证书发给申请人。
建议：
提前咨询当地的不动产登记机构，了解具体的办理流程和所需材料。
准备好所有必要的文件，确保资料齐全、准确。
按照规定的流程进行申请，以确保房屋确权手续顺利进行。