当合同中的某些条款约定不明确时，根据《中华人民共和国民法典》和相关司法解释，可以采取以下几种方式认定：
合同补充
首先，当事人可以尝试协商补充不明确的条款。
合同条款或交易习惯
如果协商不成，应依据合同的相关条款或交易习惯来确定不明确条款的内容。
法律规定
当合同条款和交易习惯均无法确定时，应依照法律的相关规定来认定。
行业惯例
在某些情况下，可以参考行业惯例来辅助确定不明确条款的内容。
法定标准
对于某些特定条款，如保证期间，如果合同中没有约定或约定不明确，可以适用法定的标准或期限，例如保证期间为6个月或2年。
司法解释
对于民间借贷中的利息约定不明，法院会根据交易习惯、市场利率等因素来确定利息。
自然人之间借贷
对于自然人之间的借贷，如果对利息没有约定或约定不明确，通常视为没有约定利息。
其他情形
对于其他类型合同，如劳动合同中的工作地点，可以根据合同明确约定、实际履行情况、行业惯例或法律规定来认定。
在处理约定不明的情况时，应遵循诚信原则，并考虑合同的性质、目的和交易习惯。