资质证办理通常需要向 建设行政主管部门提交申请。具体办理流程和所需材料可能因地区和资质类型而异，以下是一般性的指导：
三级资质：
通常可以在地级市的建委或建设局办理。
二级资质：
可以直接在省住建厅办理，但部分特殊资质可能需要直接报建设部。
一级资质：
需要先在省住建厅办理，并报住建部备案。
特级资质：
需要在住建部办理。
此外，企业资质证书的办理方法还包括以下步骤：
1. 企业先到工商行政管理部门办理营业执照。
2. 到企业所在市建设行政管理部门领取建筑业企业资质申请表。
3. 到各属地住房和城乡建设局递送申办企业建筑资质所需要核查的申请材料和所需的原件材料。
4. 各个建设行政主管部门对企业提交的材料进行审批，合格的才能拿到资质证书。
综上所述，资质证办理的具体部门为 建设行政主管部门，建议根据企业资质等级和所在地区，选择相应的建设行政主管部门进行申请。